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Stereo-seq Chip是用于mRNA定位的芯片,芯片上布滿了以規(guī)則陣列形式排布的DNA納米球(DNA Nano Ball)。對(duì)固定在芯片上的DNB進(jìn)行測(cè)序得到序列與坐標(biāo)位置Coordinate ID(CID)一一對(duì)應(yīng)的信息,后續(xù)即可通過(guò)這一映射關(guān)系將芯片捕獲到的mRNA進(jìn)行空間位置的還原。序列與CID的映射關(guān)系以h5格式文件儲(chǔ)存,即為Mask文件。Mask文件不能直接打開(kāi),需要使用Stereo-seq分析流程軟件包(Stereo-seq Analysis Workflow, SAW)進(jìn)行處理。